De 3 graden Om te kunnen werken met reiki is het noodzakelijk van een reikimeester de vier inwijdingen in de 1e graad te ontvangen. De inwijdingen kunnen in 4 avonden of 2 hele dagen gedaan worden. Tijdens de inwijdingen gebruikt een reikimeester de symbolen en mantra's (heilige woorden die bepaalde krachten activeren en sturen) die dr. Usui heeft gevonden in de oude literatuur over de wijze waarop Boeddha genas. Tijdens het ritueel moeten de ogen gesloten worden, omdat dan totale concentratie op zichzelf ontstaat. Na inwijding wordt men een kanaal voor reiki. Men kan de handen gebruiken of via de aura contact met de ontvanger tot stand brengen om de kracht te laten stromen. Ook wordt men beschermd tegen het doorgeven van de persoonlijke energie aan de ontvanger en het opnemen van ziekten van de behandelde persoon. De gevoeligheid voor fijnstoffelijke energie neemt toe, zo kan men voelen dat iedere edelsteen een andere energie heeft. Dr. Usui paste bij de opleiding van zijn leerlingen de 5 reiki levensregels toe (zie links). Bij een inwijding voor de 2e graad wordt o.a. het Derde Oog, het voorhoofdschakra, geactiveerd. Dat leidt meestal tot helderziendheid en een sterkere intuïtie. Ook hier komen de symbolen en mantra's aan bod. De inwijding kan in een avond en een dag of 3 avonden/middagen gedaan worden. Met de 2e graad kan men ook patiënten op afstand behandelen. Een afstandsbehandeling duurt korter dan een behandeling met de 1e graad: 10-20 minuten. Met de 2e graad kan men ook edelstenen van energie zuiveren en met reiki opladen. Ook kan men met energie ruimtes zuiveren. Ruimtes kunnen bijvoorbeeld belast zijn met aardstralen of entiteiten (geesten). De overdracht van energie op afstand is even sterk als bij een behandeling met lichamelijke aanwezigheid. Bij de 3e graad wordt men ingewijd voor het reikimeesterschap. Men moet dan minimaal een jaar ervaring hebben met de 2e graad. Het energiekanaal wordt nog meer geopend. Men is dan zelf in staat inwijdingen te geven aan anderen. De 3e graad duurt 12 maanden.